——财政部2006年3月受国务院委托向十届全国人大四次会议报告2005年度中央预算执行情况时，少报一项政府性基金2004年底结余21.12亿元，2005年收入5.06亿元、支出2.57亿元，年底结余23.61亿元。不符合预算法实施条例关于“经国务院批准设立的专用基金应当实行预算管理”的规定。

——2005年，财政部在政府性基金自身的收入能够满足支出需要的情况下，仍从预算内安排15亿元。这一做法不利于提高基金的使用效益。

——2005年，中国信达资产管理公司在处置一笔不良贷款时，财政部在其实际发生费用4552万元的情况下，同意其按回收现金8.54亿元的18％提取委托手续费1.54亿元。这一提取比例是信达公司实际费用率5.29％的3.4倍，是2005年财政部下达该公司考核费用率6.21％的2.89倍。

——2005年，财政部批准中国中信集团公司按上年税后可供分配利润17.54亿元的39％，提取公益金6.84亿元，不符合公司法关于法定公益金按税后利润的5％至10％提取的规定，导致该公司多提公益金5.09亿元。

——2005年，财政部从中国石油天然气集团公司上缴的所得税中退库100亿元，弥补中国石油化工集团公司炼油项目亏损。这种暗抵收入的做法违反了“收支两条线”原则，缩小了中央财政收支规模。财政部应通过财政支出的方式安排这部分资金。